Core Unit Bioinformatik, Datenintegration und -Analyse
Die CUBiDA ist eine Core Unit am Uniklinikum Erlangen, welche die biomedizinische Forschung umfassend unterstützt. Unser erfahrenes Team ist spezialisiert auf die Entwicklung und Anwendung innovativer Tools für Datenverarbeitung, statistische Analyse, Interpretation und Visualisierung in verschiedenen Bereichen, wie Genomik, Transkriptomik, Proteomik und Metabolomik.
Wir verwenden eine breite Palette an Software, mit einem besonderen Fokus auf öffentlich zugänglichen Lösungen wie Bioconductor und nf-core. Für die Entwicklung unserer Datenverarbeitungspipelines setzen wir die Programmiersprachen bash, Python und R ein. Der Zugang zur High-Performance-Computing-(HPC)-Umgebung des Datenintegrationszentrum (DIZ) gewährleistet eine effiziente und skalierbare Datenverarbeitung.
Eines unserer Werkzeuge, das wir besonders hervorheben möchten, ist cBioPortal, eine Plattform für die integrierte Analyse und Interpretation klinischer und molekularer Daten. Sie ermöglicht tiefere Einblicke in komplexe biologische Zusammenhänge und hilft dabei potenzielle therapeutische Ziele zu identifizieren.
Unsere Dienstleistungen in den Bereichen Bioinformatik und Datenintegration umfassen:
- Standard-Genomik-Analysen
- Für Ihre Forschungsfragen maßgeschneiderte bioinformatische Analysen
- Beratung zu Studiendesign, Datenanalysestrategien, Ergebnisinterpretation und Datenmanagement
- Entwicklung von maßgeschneiderten Datenmanagementplänen
- Beratung zu Datensicherheit und Datenschutz
- Entwicklung kundenspezifischer Software
- Workshops und Kurse zu einem breiten Themenspektrum